教会の最終的責任者は、奈良ブロック担当司祭団ですが、教会の運営は、その担当司祭団が招集する各小教区評議会が、教会の運営活動全般を審議し、決定します。
・宣教司牧に関する基本方針の作成
・年間行事の作成予算と決算の承認
・予算外の支出の承認など
・そして評議会によって決定された教会の方針に従い各部会が諸事業を推進し、実行の指揮を執ります。　　尚、詳しくは、「カトリック登美が丘教会小教区評議会規約」を参照してください。
小教区評議会について
　　「小教区評議会」は、以下の評議員によって構成されます。
        ・ブロック司祭団代表
　　　・信徒の代表として選出された役員（3名～5名）
　      ・各部会の代表者（6名）
小教区評議会は、原則として毎月１回（ただし、2月と8月は除く）
会議を開催しています。
部会について
　　部会は、小教区評議会で決定された方針に従って活動する執行機関です。
　　登美が丘教会には、以下の部会があり、各部会が各々の役割を分担して、諸活動を推進しています。
・典礼部   ・教育部   ・広報部   ・施設管理部    ・社会活動部　・財務部